在便秘的诊断和鉴别诊断中，根据临床需要，应做必要的检查。首先要注意有否存在报警症状及全身其他器质性病变存在的证据；对50岁以上、有长期便秘史、短期内症状加重患者应进行结肠镜检查以排除大肠肿瘤的可能；对于长期滥用泻剂者，结肠镜可确定是否存在泻剂性结肠或（和）结肠黑变病；钡剂灌肠造影有助于先天性巨结肠的诊断。
难治性便秘时可选择特殊的检查方法包括：
胃肠通过试验（GITT）；
直肠及肛门测压（RM）；
直肠-肛门反射检查；
耐受性敏感性检查；
气囊排出试验（BET）；
盆底肌电图；
阴部神经潜伏期测定试验及肛管超声检查；
结肠镜检查或钡灌肠有助于确定有无器质性病变。
饮食、生活习惯及工作情况，既往的患病史、手术史，特别是有无痔核、肛瘘及肛裂史，近来有无服药史，尤其是有无长期服用泻剂史，通过相应的检查尽可能明确导致便秘的原因。对中年以上患者，发生大便习惯改变，大便由每天1次或每2天1次，逐渐改变为每3天或数天1次者，
