初期肛瘘症状如下：
1、瘙痒：由于脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉瘙痒，肛周潮湿不适，皮肤变色、表皮脱落，纤维组织增生和增厚，有时形成湿疹。
2、疼痛：肛瘘突然疼痛，多为感染发炎，或脓液引流不畅通，但也预示病势扩散、或有新的病灶发生。疼痛的程度与病势成正比，疼痛越剧烈，病势越严重。
3、流脓：脓液多少与瘘管大小、长短、数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚。
4、排便不畅：复杂性肛瘘瘘口长期不愈，可引起肛门直肠周围形成大的纤维化瘢痕或环状的条索，影响肛门的舒张和闭合，大便时感到困难，有便意不尽的感觉。
5、全身症状：在急性炎症期和复杂性肛瘘反复发作时，可出现不同程度的发热、或伴有消瘦、贫血、体虚等长期慢性消耗症状。
